Несколько замечаний и советов:
1) С3 лишний, а иногда даже и вредный, т.к. через него вся грязь с шины питания может попасть на вход ОУ. Его лучше включить между +питания и "общим". Короче, стандартная цепь bias - см. схемы примочек Boss, DOD, Ibanez и мн. др.
2) Надо помнить, что R1 маловато для гитары, поэтому может потеряться яркость в атаке, появиться ватность в звуке, но это будет сильно зависеть от гитары (кстати, для некоторых сильно ярких датчиков может получиться наоборот - малое R_вх окажется в тему). А для упоминаемого сустейна (или иной педали) такой R вполне нормален.
3) Р3 лучше отделить конденсатором от эмиттера, а то при регулировании могут появиться шуршики. Естественно, при этом необходимо добавить эмиттерный резистор 10 кОм. В общем, традиционная схема.
4) Я бы поставил потенциометр Гейн - сейчас это практически обязательная регулировка. Можно регулировать R4, тогда появится возможность реализовать ФВЧ, f которого зависит от уровня гейна (для этого лучше уменьшить С2). Так сделано в MXR D+ и др. Либо R5 - как в Тьюб Скримере.
5) Если нойс-гейт делать по уму, то сигнал на детектор лучше подавать не с выхода, где сигнал ограничен (скомпрессирован), а со входа - в этом случае фаза закрывания будет более плавной. Естественно, необходимо будет добавить усилитель - хоть на ОУ, хоть на транзисторах. Хотя, сейчас проще, это факт.
6) Правую обкладку С16 необходимо притянуть к земле резистором 100-300 кОм, а то при переключении возможно появление щелчков.
7) Да и вообще, байпас организован неправильно - на выходе будет присутствовать потенциал или 1/2 питания (чистый), или непонятно какой потенциал (зависит от того, что включено после) в положении драйв. Поэтому, правильней будет чистый снимать через конденсатор и притягивающий к земле резистор (как и в случае с С16). В этом случае, на выходе всегда будет присутствовать 0 и щелчков не будет. Это тоже стандартный подход и стандартная схема.

На вход необходимо включить последовательный резистор 3-5 кОм. Без него иногда можно словить радио и/или возбуд. Кроме того, при превышении напряжения на входе (статика, импульсы при горячей коммутации и т.п.) может выгореть или деградировать входной каскад ОУ. Такой R ограничивает ток и часто спасает ОУ.
9) С такими номиналами R1 и C2 f_среза_ФВЧ_по_входу = 1,6 Гц, т.е. примочка пропускает инфраниз. Обычно так не делают, т.к. можно наловить кучу помех (зависит от датчиков).