Тоже пришел к этому выводу, покрутив блок в разных положения. Попробую сделать кожух для блока из оцинкованного железа.
Если выяснится, что бОльшую часть низкочастотного фона составляет наводка на трансформатор развязки (при перемещении или повороте фон изменяется), то кожух из оцинковки не поможет, он сильно тонкий и не спасает от электромагнитных помех силового трансформатора. Это надо силовик упаковать в стальной экран толщиной от 1 мм (крышки), пакет его заземлить, или перемотать, добавив в первичную от 400 витков и, соответственно, во вторичные по КТ.
Попробуйте зашунтировать вторичную обмотку согласующего трансформатора резистором на эквивалент для Вашего КТ и входа, сколько там? ...50 Ом с модуля? Всё равно трансформатор работает на низкоомном импедансе, а это менее чувствительно к наводкам, чем высокоомная цепь, когда модуль что-то там изменяет на выходе.